Des suivis scientifiques sur les habitats naturels posidonie, coralligène, rocheux et substrats meubles ainsi que des récifs artificiels sont réalisés par les agents de l’AMP. Ces suivis permettent à l’AMP :
De croissance lente, la posidonie est étudiée tous les 3 à 6 ans depuis 2001 sur Agde. Le suivi in situ des ces herbiers constiste en :
A partir de ces données collectées et de leurs analyses, des indicateurs de l’état de conservation des herbiers de Posidonie issus de la littérature scientifique sont calculés.
Depuis 2010, le coralligène est suivi tous les 3 ans environ pour évaluer son état de conservation.
Des photographies sous-marines sont prises pour déterminer les espèces fixées (éponges, bryozoaires…) sur cet habitat et leur emprise surfacique. Un inventaire des animaux mobiles est aussi réalisé en parallèle.
Depuis 2020 avec la création de la réserve marine, un des trois sites suivis est situé dans la réserve et sert de point de référence pour l’évaluation de l’efficacité de la réserve marine.
A partir de ces données collectées et de leurs analyses, des indicateurs de l’état de conservation du coralligène issus de la littérature scientifique sont calculés.
Selon la profondeur où la roche est située, les organismes marins la colonisant vont différer. L’état de conservation des fonds rocheux est évalué à partir d’inventaires d’organismes marins associés à ces habitats.
Sur les petits fonds rocheux (moins d’1 mètre), les algues (comme les cystoseires) sont les indicateurs de l’état de conservation cet habitat. Ces évaluations ont été réalisées ponctuellement par des scientifiques depuis 1982.
En 2021, de nouveaux outils comme le drone ont permis de dresser un inventaire haute résolution de ces peuplements d’algues, permettant de localiser et d’évaluer leurs surfaces précisément.
Cet inventaire est voué à être régulièrement mis à jour pour permettre, entres autres, de servir d’état de référence en cas de pollution (comme une marée noire).
Depuis 1985 de nombreux récifs artificiels ont été immergés le long de littoral agathois pour favoriser le maintien de la pêche artisanale (lutte contre le chalutage illégal, production de ressource halieutique). En 2009 l’AMP, avec le soutien des pêcheurs agathois, a immergé 99 récifs artificiels.
Pour évaluer l’efficacité de ces récifs artificiels en tant que soutien à la pêche et leur intérêt biologique et écologique, un suivi a été réalisé annuellement entre 2009 (avant immersion des récifs) et 2014. Cette étude a consisté en deux suivis :
Certains récifs artificiels immergés en 2009 étant situés aujourd’hui dans la réserve marine, ces suivis servent aussi à évaluer l’impact dans le temps de la réserve marine, en comparant des récifs artificiels dans la réserve et d’autres hors réserve.
