Un des impacts causant la destruction des petits fonds côtiers au Cap d'Agde est lié aux systèmes de maintien "traditionnel" des bouées des 300 mètres. Pour diminuer cet impact une suite d'actions vers un balisage non impactant a été mené depuis 2013.
Des bouées de mouillages écologiques ont été mises en place afin d'éviter aux navires de jeter leur ancre et d'endommager les fonds marins. Deux secteurs ont ainsi été pourvus de bouées écologiques : les secteurs des Tables et celui de Brescou.
La réserve marine du roc de Brescou est une zone de protection mise en place depuis 2020 à l'initiative des pêcheurs petits métiers et concertée avec les acteurs locaux. Des suivis scientifiques sont menés pour quantifier et qualifier l'efficacité de cette réserve.
